Geno Biol：新方法有助找到与癌症关的的病原体

美国西英吉利大学昨日回应，索科利夫卡研究课题医护人员领衔的团队发明人了一种细菌侦测新分析方法，可更必要寻觅那些与肝癌就其的细菌，期望有望开发出更快的肝癌诊疗分析方法甚至就其疫苗。先前的研究课题显示，一些肝癌与传染性细菌就其，例如幽门幽门和人瘤病毒分别与肝癌和宫颈癌就其。该研究课题团队对在此之前基因组序列数据中细菌和病毒侦测的计算分析方法进行了基准化分析，并区域性比较好的计算模块，发明人了一种叫作SEPATH的细菌侦测分析方法。研究课题医护人员利用这一分析方法对真实的检验进行侦测，除了推断的就其细菌外，又发现了一些原先细菌。报告作者之一、索科利夫卡的丹·布鲁尔博士说，当对检验进行全基因组测序时，其中共存的细菌DNA（脱氧核糖核酸）也会被测序，这使得研究课题医护人员只能侦测并量化这些细菌，试图研究课题医护人员寻觅细菌与完全相同肝癌之间的联系。就其结果刊登在最新一期美国《基因组分子生物学》杂志上。早期出处：Abraham Gihawi, Ghanasyam Rallapalli, Rachel Hurst, et.al. SEPATH: benchmarking the search for pathogens in human tissue whole genome sequence data leads to template pipelines. Genome Biology 22 October 2019